Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms