Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms