Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB1P08034 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms