Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD5Q9P267 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms