Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GTF3C6Q969F1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF3C6Q969F1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GTF3C6Q969F1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GTF3C6Q969F1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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