Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms