Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf40Q8IXQ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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