Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHKAPQ2M3C7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHKAPQ2M3C7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms