Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
COL4A6Q14031 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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COL4A6Q14031 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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