Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms