Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms