Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PTPRAP18433 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRAP18433 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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