Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms