Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRATO95237 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRATO95237 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRATO95237 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRATO95237 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms