Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HHLA1C9JL84 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms