Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9Y3F1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.5 ms