Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MKLN1Q9UL63 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms