Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms