Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms