Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms