Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CCDC96Q2M329 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC96Q2M329 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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