Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms