Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGNL1Q0VF96 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CGNL1Q0VF96 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms