Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5F1P24539 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms