Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RGPD3A6NKT7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RGPD3A6NKT7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms