Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MBD1Q9UIS9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MBD1Q9UIS9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms