Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MLH3Q9UHC1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms