Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL13Q9P2N7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms