Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms