Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT1Q5M7Z0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms