Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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