Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB38P57729 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms