Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-FP30511 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms