Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms