Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ECSITQ9BQ95 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms