Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ULK4Q96C45 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms