Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF4BQ92750 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms