Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms