Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM41Q8WV44 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms