Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C17orf58Q2M2W7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms