Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALX1Q15699 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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