Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMC1AQ14683 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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