Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EBI3Q14213 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms