Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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