Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXF2Q12947 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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