Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNB3Q05901 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms