Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms