Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hoxd13P70217 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hoxd13P70217 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hoxd13P70217 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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