Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDF5P43026 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GDF5P43026 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GDF5P43026 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GDF5P43026 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms