Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms